প্রথমত, যদিও উভয় ধরনের ওয়াটার পিউরিফায়ারই পানির অমেধ্যকে বিশুদ্ধ করতে পারে, তবে তাদের পরিশোধন নীতি এক নয়। RO রিভার্স অসমোসিস ওয়াটার পিউরিফায়ার ভিতরে একটি RO রিভার্স অসমোসিস মেমব্রেন দিয়ে সজ্জিত। চাপের ক্রিয়ায়, জল RO ঝিল্লির মধ্য দিয়ে যেতে পারে, যখন অজৈব লবণ, ভারী ধাতু আয়ন, ব্যাকটেরিয়া এবং ভাইরাসের মতো অমেধ্যগুলি বিপরীত অসমোসিস ঝিল্লি দ্বারা অবরুদ্ধ হয়।

আল্ট্রাফিল্ট্রেশন ওয়াটার পিউরিফায়ারগুলি তাদের অভ্যন্তরীণ আল্ট্রাফিল্ট্রেশন মেমব্রেনের মাধ্যমে জলের উত্সকে বিশুদ্ধ করে। চাপের পার্থক্যের ধাক্কায়, জলের উৎস ঝিল্লির এই স্তরের মধ্য দিয়ে যেতে পারে এবং অমেধ্য ফিল্টার করতে পারে।

দুই ধরনের ওয়াটার পিউরিফায়ার, যা বিভিন্ন বিশুদ্ধকরণ পদ্ধতি ব্যবহার করে, তাদের নীতি অনুসারে বিশুদ্ধকরণের নির্ভুলতায় কিছু পার্থক্য রয়েছে। RO রিভার্স অসমোসিস ওয়াটার পিউরিফায়ারের ভিতরে একটি RO মেমব্রেন থাকে এবং এই মেমব্রেনের ছিদ্রগুলি ন্যানোমিটার লেভেলের মতো ছোট। এমনকি ক্ষুদ্র ভাইরাস এবং ব্যাকটেরিয়াও RO মেমব্রেনের ছিদ্রের চেয়ে হাজার গুণ বড়। অতএব, যে জল RO মেমব্রেনের মধ্য দিয়ে যায় তাতে মূলত কেবল জল থাকে এবং অন্য কোনও উপাদান থাকে না এবং ফিল্টার করা জল সরাসরি বা ফুটিয়ে পান করা যেতে পারে।

আল্ট্রাফিল্ট্রেশন ওয়াটার পিউরিফায়ারের ভিতরে একটি আল্ট্রাফিল্ট্রেশন মেমব্রেন থাকে এবং এই ফিল্টারিং মেমব্রেনের ছিদ্র আকারের নির্ভুল পরিসর হল 0.01~ 0.001μm, যা RO রিভার্স অসমোসিস ওয়াটার পিউরিফায়ারের চেয়ে বড় মাত্রার এক অর্ডার। একই সময়ে, আল্ট্রাফিল্ট্রেশন মেমব্রেন কেবল জলকে অতিক্রম করতে দেয় না তবে কিছু ছোট আণবিক পদার্থকেও ছোট আয়তনের মধ্য দিয়ে যেতে দেয়, যেমন কিছু খনিজ উপাদান।